大教堂由西奥多里奇（Theodoric）设计和建造为他的阿里安宫殿教堂，如《自由教宗》（Liber Pontificalis）中所述，大教堂在561年被重新奉为天主教教堂，以压制对西奥多里奇的阿里安信仰的所有提及，包括对其罗马马赛克的重新制作。856年，当圣阿波利纳里斯的遗物从卡莱的圣阿波利纳雷大教堂转移出来，以保护他们免受掠夺性海盗的侵害时，它又被重新命名。

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        尽管进行了相当大的翻新和现代化改造，大教堂仍保留着大量的古代马赛克艺术，展示了基督的教,、奇迹和激情具有重要的学术意义。例如，一些历史学家认为，其中一个马赛克包含了撒旦在艺术史上的首次代表。

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        在马赛克图中，耶稣的左边描绘了一个蓝色天使，背后是三只山羊（圣马修在其审判日中提到）。被联合国教科文组织列为世界遗产的圣阿波利纳雷·诺沃大教堂是中世纪早期欧洲宗教艺术最重要的遗址之一，尤其是因为它融合了东西方基督教的图案-如大胡子所示（东正教）和无胡子（罗马）的基督像。